No final da temporada anterior, o vírus protomolécula já tinha tomado conta de Eros e ameaçava a segurança de todo o sistema solar. Neste momento, uma conspiração ainda maior para controlar a protomolécula está a ser desvendada. Entretanto, a subsecretária-geral das Nações Unidas, Avasarala, e a soldado marciana Bobbie Draper tentam revelar a verdade para impedir uma guerra entre a Terra e Marte. Enquanto isso, o líder da estação espacial Tycho, Johnson, pretende aproveitar a oportunidade para colocar-se em pé de igualdade com a Terra e Marte. Mas... as criaturas misteriosas já fugiram ao controlo...