Num mundo futurista, o exército desenvolve um soro para potenciar a capacidade de combate dos soldados, mas o plano sai mal e resulta na contaminação de numerosos civis com uma fórmula experimental falhada, dando origem a uma comunidade de seres bioquímicos com corpos diferentes dos humanos normais. O exército constrói um enorme complexo de isolamento e desenvolve uma arma definitiva para lidar com estes seres bioquímicos. Em resposta, a organização bioquímica envia a guerreira Violeta (interpretada por Milla Jovovich) para se infiltrar nas fileiras militares e, através de meios violentos, roubar a arma definitiva. Incapaz de conter a curiosidade, Violeta abre a embalagem da arma durante o caminho e descobre que esta contém um rapaz (interpretado por Cameron Bright). Afinal, o rapaz possui um antigénio sanguíneo capaz de eliminar os bioquímicos. Violeta acredita que este antigénio também pode reverter os bioquímicos à forma humana e, descontente com os métodos brutais da sua organização, decide traí-la. Ela foge com o rapaz, que se identifica como "Número 6", embarcando numa jornada desesperada para escapar tanto do exército como da organização bioquímica. Porém, segredos ainda maiores escondem-se por trás da identidade do rapaz.