Nas profundezas das florestas selvagens do Canadá, Logan, o "Wolverine" (interpretado por Hugh Jackman), atormentado pela maldição da imortalidade, vive em reclusão. Durante um confronto com caçadores, ele recebe ajuda de Yukio (Fukushima Rila), uma mulher japonesa. Yukio é subordinada de Ichirō Yashida, um velho conhecido de Logan da Segunda Guerra Mundial, que, aparentemente à beira da morte, deseja rever Logan uma última vez. Atravessando oceanos, Logan finalmente encontra o frágil Ichirō, que lhe pede para proteger a sua neta, Mariko Yashida (Okamoto Tao). Com a morte do ancião, o funeral é subitamente palco de um violento conflito. Com a ajuda de Yukio, Logan arrisca a vida para salvar Mariko, enquanto Shingen Yashida (Sanada Hiroyuki), filho de Ichirō, parece ter intenções ocultas. Durante a fuga, Logan descobre, inesperadamente, que perdeu a sua capacidade de regeneração - a maior crise do Wolverine está prestes a desenrolar-se...