Lincoln (interpretado por Ewan McGregor) e Jordan (interpretada por Scarlett Johansson) acreditavam viver numa comunidade isolada do mundo. Segundo os cientistas, eram os últimos seres humanos sobreviventes na Terra. Dentro do seu grupo, seriam sorteados escolhidos para serem enviados para viver numa ilha paradisíaca. No entanto, até serem selecionados, tinham de suportar uma vida sem liberdade e sob rigorosa vigilância. Quando Lincoln e Jordan foram "sortudos" o suficiente para ser escolhidos, descobriram um segredo chocante: afinal, a tal ilha paradisíaca não existia e eles próprios eram apenas versões clonadas dos habitantes da ilha; a sua ida para a ilha não lhes reservava uma vida bela, mas sim a extração dos seus órgãos vitais para salvar a humanidade. Lincoln testemunhou com os próprios olhos como o seu amigo foi dissecado sob o bisturi. Perante isto, Lincoln decidiu firmemente fugir com a sua namorada Jordan, iniciando uma jornada pela sobrevivência...