Com o desastre sem precedente conhecido como "Terramoto Espacial", surgiram raparigas misteriosas chamadas "Espíritos". Perante estas figuras consideradas catástrofes devido ao seu poder avassalador, a humanidade nunca cessou os seus esforços para as combater ao longo de décadas. As medidas normalmente adoptadas pelos humanos consistem em eliminá-las pela força, ou então — "Namorar com elas até as fazer corar"! Ao fazer uma Espírito corar e selar o seu poder através de um "beijo", é possível converter essa energia em força própria. O estudante do ensino secundário Shido Itsuka, possuindo esta capacidade, embarca em "encontros" com elas tanto pela paz da humanidade como para salvar os Espíritos. No dia a dia, Shido precisa de conter a sua imensa energia espiritual que outrora arrastou os Espíritos para conflitos, embora por vezes a utilize para as proteger. Desta forma, ele repetidamente resgata Espíritos como Tohka Yatogami do perigo, enquanto a relação entre humanos e Espíritos — bem como as formas de lidar com ela — começam a mudar silenciosamente... Paralelamente, existem organizações que empregam métodos distintos da "Ratatoskr" a que Shido pertence, confrontando os Espíritos de maneira alternativa. A breve calmaria está prestes a chegar ao fim, e a guerra (ou os encontros) de Shido e dos outros está prestes a recomeçar —