No final do século XXI, a tecnologia humana tinha atingido um nível altamente avançado, a clonagem humana e as viagens espaciais já eram uma realidade, deixando de ser um sonho. Paralelamente, muitos cientistas continuavam a investigar incansavelmente os segredos e a verdade sobre as origens da humanidade. Através do estudo e comparação de várias civilizações antigas, os cientistas Elizabeth Shaw (interpretada por Noomi Rapace) e Charlie Holloway (interpretado por Logan Marshall-Green) descobriram que os seres humanos poderiam ter sido criados por alienígenas de uma galáxia distante. Com o financiamento da corporação Weyland, embarcaram na nave espacial Prometheus, comandada por Vickers (interpretada por Charlize Theron), em direção a esse planeta desconhecido.Após a exploração local, a teoria dos terrestres foi confirmada com sucesso. No entanto, a sua investigação precipitada dos "segredos dos deuses" levou-os a um abismo de perdição sem retorno...