A ciência fundamental da Terra sofreu perturbações anómalas, causando agitação e inquietação na comunidade científica. Vários casos de suicídio de cientistas ocorreram sucessivamente. O cientista de física aplicada Wang Miao foi levado pelo agente Shi Qiang para o Centro de Operações Conjuntas e infiltrou-se numa organização chamada "Fronteira da Ciência" para auxiliar na investigação. Posteriormente, Wang Miao começou a ver uma misteriosa contagem decrescente fantasma e testemunhou o piscar do universo. Através do jogo "Três Corpos" e de algumas reuniões, Wang Miao contactou uma organização denominada ETO. À medida que as névoas se dissipavam gradualmente, descobriu-se que a líder desta organização era Ye Wenjie, a mãe de Yang Dong, uma cientista que cometera suicídio. Mas por que razão Ye Wenjie fundou uma organização como esta?