A história desenrola-se no final do período Edo, onde o mais temível ninja condenado à morte, "Ganmimaru", na esperança de reencontrar a sua amada esposa, junta-se ao carrasco "Yamada Asaemon Sagiri" numa viagem a uma ilha conhecida como Terra Pura. Aí, procuram o "elixir da imortalidade" para trocar pela sua liberdade, enfrentando criaturas misteriosas e outros condenados em mortais confrontos na ilha.