A história desenrola-se num Japão alternativo, no 64.º ano da era Meiji, onde Tokugawa Yoshinobu detém o poder. A nação desenvolve-se de forma única, misturando elementos de Edo com avanços científicos, sustentada pela fonte de energia "Veias do Dragão". Porém, por detrás da prosperidade, a organização anti-sistema "Serpente" alimenta as chamas da revolução. O governo Tokugawa incumbe a organização secreta "Nue" de a erradicar. A protagonista, Yukimura Emu, que testemunhou o extermínio da sua família na infância, atua como carrasco dos "Nue", perseguindo incessantemente os membros da Serpente, em particular Jabunome, para vingança...