Illya é uma rapariga comum que estuda na Academia Homurabara. Um dia, é forçada a celebrar um contrato com a "Ruby Mágica", um espírito artificial natural da Varinha Kaleidoscópica, tornando-se assim na "Illya, a Rapariga Mágica". Sob as ordens de Rin Tohsaka, a antiga detentora da Varinha Kaleidoscópica, ela vê-se obrigada a começar a ajudar na recuperação dos Cartões de Classe...