O protagonista desta obra, Rintarou Okabe (voz de Mamoru Miyano), é um estudante universitário que sofre de uma grave "doença do segundo ano do ensino médio". Autointitulado "Kyouma Hououin", ele e os seus companheiros formaram o "Laboratório de Invenções do Futuro", realizando várias invenções excêntricas e investigações num laboratório modesto localizado em Akihabara.