As tartarugas ninja estão de volta! Mas agora com uma série de televisão. Quando as Tartarugas são aceites como humanos e vão para o liceu enquanto continuam a ser heróis, enfrentam a pressão de ter de fazer as duas coisas ao mesmo tempo. Com o vilão original da série de 1987, as tartarugas também têm de lutar contra o Shredder.